Retour LIPN
Recherche
Guillaume Santini
Organisation de Congrès
  1. MARAMI 2012
    3ième conférence sur les Modèls et Analyse de Réseaux: Approches Mathématiques et Informatiques. Villetaneuse - France, 17-19 octobre 2012.
    - Site officiel -
  2. JFGG'2012
    3ième journées EGC Fouille de Grands Graphes. Villetaneuse - France, 17-19 octobre 2012.
    - Site officiel -
  3. IMS'06
    International Mathematica Symposium sont les gongrès internationaux des utilisateurs du langage de calcul formel Mathematica. Avignon - France, 19 - 23 Juin 2006.
    - Site officiel -
Prévision d'apparition de liens dans les graphes sociaux
2010-2012Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, LIPN, CNRS(, UMR 7030), F-93430, Villetaneuse, France

Identification et classification des cœurs protéiques à partir de graphes d'alignements structuraux
2007-2009Post-Doctorat - Atelier de Bio-Informatique Université - Paris 6
  • Développement d'un programme d'alignement multiple de structures protéiques (Gibbs sampling),
  • Clustering de graphes de concordance de similarités structurales.

Développement d'un logiciel de peak-picking adapté au traitement de signaux d'électrophorèse capillaire
2007Contrat Privé - MEDIT SA. (Palaiseau)
  • Conception et développement d'une application industrielle avec Mathematica,
  • Traitement de signaux.

Etude par dynamique moléculaire de l'impact de sucres modifiés sur la flexibilité structurale et la géométrie des empilements des dimères de thymine
2004-2006ATER - Université Paris 6, Etude menée en collaboration avec l'équipe de P. Clivio de l'Institut de Chimie des Substances Naturelles du CNRS à Gif-sur-Yvette-
  • Dynamique moléculaire et minimisation énergétique avec le programme AMBER de dimères de thymines avec et sans modifications chimiques,
  • Cartes adiabatiques d'énergie potentielle

Vers la prédiction de la structure tridimensionnelle des épibgles à cheveux d'ADN et d'ARN comportant un appariement dans la boucle à partir de la théorie de l'élasticité et de la mécanique moléculaire
2000-2005Thèse de Doctorat, - Fichier PDF -
ED Inter///Bio (Biophysique) de l'Université Paris 6i
Sous la direction du Pr. J. Cognet au laboratoire de Biophysique Moléculaire, Cellulaire et Tissulaire (BioMoCeTi - UMR 7033- CNRS/Paris 6/Paris 13)
  • Développement théorique et informatique d'une nouvelle approche de modélisation moléculaire : Biopolymer Chain Elasticity (BCE),
  • Modélisation de structures en épingle à cheveux d'ADN et d'ARN,
  • Développement et programmation de l'approche BCE et du logiciel de modélisation S-mol,
  • Dynamique Moléculaire en solvant explicite de structures en épingles à cheveux d'ADN,
  • Résolution de la structure d'une épingle à cheveux d'ADN en collaboration avec l'équipe de RMN de Mlle C. Cordier de l'ITODYS à l'Université Paris VII.

Comparaison de structures cristallines de la béta-cristalline
1999Stage d'été au Laboratoire de Minéralogie Cristallographie de Paris- Université Pierre et Marie Curie - Paris VI - (mi-juin à juillet 1999)
  • Comparaison de structures de béta-cristallines et représentation avec le logiciel de modélisation Insight,
  • Comparaison de profils électrostatiques de plusieurs béta-cristallines.